保税地域にあって、港頭地区(岸壁後背地)で海上コンテナを一時保管しておく施設のこと。船積されるまで保管されるコンテナおよび船から揚げられ引き取られるまでのコンテナが保管される。コンテナヤードは保税地域となっており、通関手続きなど輸出入に関する諸手続も行われる。